Em 2022, 18 escolas da rede municipal de ensino de São José ofereciam AEE (Atendimento Educacional Especializado). Nesse ano, esse número subiu para 25.
Esses polos focam em estratégias diversificadas para facilitar o processo de aprendizagem de crianças e estudantes com deficiência, com transtornos globais do desenvolvimento e altas habilidades, matriculadas nas unidades municipais.
Uma das unidades é o Centro de Estimulação e Reabilitação em Transtorno do Espectro Autista (Certea), no bairro Praia Comprida, atendendo crianças dos Centros de Educação Infantil (CEIs) Professora Araci Olivia da Silva, Bom Jesus de Iguape e Professora Ana Sperandio Battisti.
Nos últimos anos, foi registrado um aumento no ingresso de alunos que fazem parte do público-alvo do Atendimento Especializado. Em 2020, o Setor de Educação Especial, da Secretaria Municipal de Educação, contabilizou 525 crianças e estudantes com deficiência matriculados e neste ano soma cerca de 1200.
Os professores do AEE têm formação em Pedagogia e complementação em Educação Especial. Além do atendimento direto ao público infantojuvenil, esses profissionais orientam e assessoram os pais, responsáveis e profissionais da unidade escolar para contribuir com a efetiva participação e inclusão das crianças e estudantes.